三格化糞池由相聯的三個池子組成，中間由過糞管聯通，主要是利用厭氧發酵、中層過糞和寄生蟲卵比重大于一般混合液比重而易于沉淀的原理，糞便在池內經過30天以上的發酵分解，中層糞液依次由1池流至3池，以達到沉淀或殺滅糞便中寄生蟲卵和腸道致病菌的目的，第3池糞液成為優質化肥。
新鮮糞便由進糞口進入第一池，池內糞便開始發酵分解、因比重不同糞液可自然分為三層，上層為糊狀糞皮，下層為塊狀或顆狀糞渣，中層為比較澄清的糞液。在上層糞皮和下層糞渣中含細菌和寄生蟲卵最多，中層含蟲卵最少，初步發酵的中層糞液經過糞管溢流至第二池，而將大部分未經充分發酵的糞皮和糞渣阻留在第一池內繼續發酵。流入第二他的糞液進一步發酵分解，蟲卵繼續下沉，病原體逐漸死亡，糞液得到進一步無害化，產生的糞皮和糞 厚度比第一池顯著減少。流人第三池的糞液一般已經腐熟，其中病菌和寄生蟲卵已基本殺滅。第三池功能主要起儲存已基本無害化的糞液作用。
三格化糞池容積的計算方法
三格化糞池容積應根據使用人數、糞便發酵腐熟的時間以及沉卵滅菌的要求來決定。一般我國通用計算參數是每人每天的糞尿排泄量，包括少量沖洗廁所用水在內，按3．5公斤(最低量)計算，糞便發酵腐熟時間及病原體殘廢時間按30天計算，其中在第一池需停留20天，第二池停留10天，第一池和第二他的容積分別按此停留時間計算，第三池容積一般為一、二池之和。糞池容積的計算式如下：
糞池容積=（排糞尿量／日/人x使用人數x天數）/1000
舉例：4口人之家，排糞尿量／日/人，按3．5kg計，糞便貯存發酵時間30天，求一、二池有效容積。
第一池有效容積＝3.5X4X20/1000＝0.28m3 第二池有效容積＝3.5X4x10/1000＝0.14m3
第一池為0.28m3，第二池為0.14m3；第三池為1-2池之和，即0.42m3。 考慮到便器的清洗次數、實際用水量不便掌握和便于施工等情況，糞池容積比計算結果大15-25％以上為宜。
